扬州市发展和改革委员会设有部门:国民经济综合处(政策研究室)、组织人事处、价格处、市价格认证中心(市价格认定局、市成本调查监审中心)、市价格监测中心、经济体制改革处、基础设施发展处(长江经济带发展处)、法规处(行政审批处)、发展战略和规划处(市规划落实推进工作办公室)、农村经济处、社会发展处(就业收入分配和消费处)、办公室、财务审计处、市政府驻外联络处(办事处)、扬州粮食职工中等专业学校、市粮食储备总公司、市粮油供应公司、长城军粮供应公司、组织人事处、服务业处(经济贸易处)、资源节约和环境保护处。协助分管国民经济综合处(政策研究室)、经济运行调节局、能源处(扬州市电力和油气输送管道保护办公室)、机关党委(机关纪委)、粮食和物资储备处、扬州粮食储运加工有限公司(市粮油购销公司)、粮食和物资监督检查处(安全仓储与科技处)、市军粮供应站、区域经济处(长三角区域一体化发展处)、支援合作处、创新和高技术发展处(工业处)、固定资产投资处(评估督查处)。